國際上通用的巴氏消毒法主要有兩種：
1將牛奶加熱到62-65℃，保持30分鐘。這種方法目前在廣東較少使用。采用這一方法，可殺死牛奶中各種生長型致病菌，滅菌效率可達(dá)97.3％-99.9％，經(jīng)消毒后殘留的只是部分嗜熱菌及耐熱性菌以及芽孢等，但這些細(xì)菌占多數(shù)的是乳酸菌，乳酸菌不但對人無害反而有益健康。
2將牛奶加熱到75-90℃，保溫15-16秒，其殺菌時間更短，工作效率更高。但殺菌的基本原則是，能將病原菌殺死即可，溫度太高反而會有較多的營養(yǎng)損失。巴氏消毒的方法的溫度為63-85℃高溫消毒：
高溫消毒：所謂高溫消毒，又稱無菌消毒，一般是通過高壓高溫的方式，將溫度提升到120℃以上，來殺死細(xì)菌。
巴氏消毒和高溫消毒的不同之處在于，巴氏消毒只是殺死牛奶中90％以上有害的細(xì)菌，但是保留其中絕大部分的有益細(xì)菌。而高溫消毒則是是殺死所有的細(xì)菌，不論是否有益的病菌，通常奶粉，和絕大部分各種各樣的“牛奶”，“果奶”“鮮奶”都是通過無菌消毒的。
只有酸奶是經(jīng)過巴氏消毒，并保存在適當(dāng)?shù)臏囟�，使奶漿中的有益菌進(jìn)一步發(fā)酵，成長，之后飲用。所以為什么很多人愿意喝酸奶。主要差別在這里。
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